سازمان انرژی اتمی جمهوری اسلامی بامداد یکشنبه با انتشار بیانیهای به حمله هوایی آمریکا به سایتهای هستهای فردو، نطنز و اصفهان واکنش نشان داد و آن را «وحشیانه، مغایر با قوانین بینالمللی» و خلاف معاهده عدم اشاعه تسلیحات هستهای (NPT) توصیف کرد.
در این بیانیه، ضمن متهم کردن آمریکا به «پذیرش مسئولیت رسمی» حمله از طریق اظهارات رئیسجمهوری این کشور، از «بیتفاوتی و حتی همراهی آژانس بینالمللی انرژی اتمی» نیز انتقاد شده است.
سازمان انرژی اتمی در پایان تاکید کرد که مسیر توسعه صنعت هستهای ایران، با وجود این حملات، متوقف نخواهد شد و پیگیریهای حقوقی در دستور کار قرار گرفته است.