پس از انتشار گزارش‌هایی درباره کشته شدن محمدباقر محمدباقروف در منطقه خودمختار بدخشان کوهستانی در شهر خاروغ تاجیکستان، کمیته رشد جماعت‌خانه‌ها در این کشور اعلام کرد محمدباقروف از نظر دینی و مذهبی «هیچ مقام و وکالتی برای رهبری شیعیان اسماعیلی در تاجیکستان» نداشت.
پیشتر در گزارش‌ها درباره کشته شدن محمدباقروف با گلوله به دست یک فرد ناشناس، از او به عنوان «رهبر شیعیان در این منطقه» نام برده شده بود.
مظفر جاروباو، رییس کمیته رشد جماعت‌خانه‌ها، با انتشار بیانیه‌ای نوشت: «شیعیان امامی اسماعیلی تاجیکستان مثل دیگر شیعیان اسماعیلی نزاری والاحضرت کریم آقاخان را رهبر یگانه دینی و مذهبی خود می‌شناسند و در سطح محل فعالیت آنها را کمیته رشد جماعت‌خانه‌ها معرفی می‌نماید.»
هنوز هیچ فرد یا گروهی مسئولیت حمله به محمدباقروف را برعهده نگرفته است.
منطقه بدخشان کوهستانی از زمان پایان جنگ داخلی پنج ساله تاجیکستان در سال ۱۹۹۷ گرفتار تنش بوده است.
در روزهای اخیر نیز شهر خاروغ، مرکز منطقه بدخشان کوهستانی، صحنه تظاهرات در اعتراض به برکناری فرماندار این شهر بود که با مداخله نیروهای امنیتی مواجه شد.